多重單堿基延伸SNP分型技術(shù)(multiplex SNaPshot)由美國(guó)應(yīng)用生物公司開發(fā)，主要針對(duì)中等通量的SNP分型項(xiàng)目。在一個(gè)含有測(cè)序酶、4種熒光標(biāo)記的ddNTP、緊挨多態(tài)位點(diǎn)5′端的不同長(zhǎng)度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引物延伸一個(gè)堿基即終止，經(jīng)AB測(cè)序儀跑膠后，根據(jù)峰的顏色可知摻入的堿基種類，從而確定該樣本的基因型，根據(jù)峰移動(dòng)的膠位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn)。對(duì)于PCR產(chǎn)物模板可通過(guò)多重PCR反應(yīng)體系來(lái)獲得。與其他SNP分型技術(shù)(RFLP、Taqman、SNPstream)相比，多重單堿基延伸SNP分型技術(shù)具有如下優(yōu)勢(shì)。①分型準(zhǔn)確，其準(zhǔn)確度僅亞于直接測(cè)序。②多位點(diǎn)同時(shí)檢測(cè)，可以同時(shí)檢測(cè)達(dá)12個(gè)位點(diǎn)，而RFLP及Taqman -次僅能檢測(cè)一個(gè)。③不受SNP位點(diǎn)多態(tài)特性限制，不管該位點(diǎn)是G/C、A/T、G/A、C/T還是插入／缺失多態(tài)，都可以放在一個(gè)體系中檢測(cè)。④不受樣本量的限制。⑤可以檢測(cè)出受污染的樣本，如果一個(gè)樣本的分型嶧譜偏離正常的分布，它可以提示該樣本可能受到污染或濃度過(guò)低，而其他分型方法則不能做到這一點(diǎn)。
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